Le premier seigneur de Sainte-Anne, Michel Gamelain, ne conserve ce titre qu'une courte période, puisqu'il cède sa seigneurie à Edmond de Suève et à Thomas de Lanouguère, tous deux officiers du Régiment Carignan-Salières. La transaction est officialisée en 1672 par l'Intendant Talon qui consacre les deux hommes co-seigneurs des lieux. Ils se partagent le territoire en deux seigneuries distinctes : Sainte-Marie à l'ouest, et Sainte-Anne à l'est.

En 1704, la veuve Lanouguère cède les titres de Sainte-Anne à son fils, Pierre-Thomas, et à son épouse, Madeleine de Verchères. Sous leur règne, la seigneurie traverse une de ses périodes les plus mouvementées.